求perl教程

《perl语言入门》到第5版了

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《perl实例精解》到第4版了

两本都不错，你自己挑一本吧，我是从perl实例精解开始的。

perl不大分unix和windows的

24小时系列

新手求助关于perl--如何打开fsa文件以及提取数据

首先，文件名应该用双引号"或单引号'引，而不是反引号`引。

其次，不应该是一行算一个序列吧，应该是遇到顶头的>算一个序列吧。

因此，要统计序列数目：

#!/usr/bin/perl

$filename

="sequence.fsa";

open(FILE,

$filename)

||

die("Couldn't

read

file

$filenamen");

while

（$line

=）{

if($line

=~

/^>/

){

$seq_num

++;

}}

print

$seq_num;

close

FILE;

要想打印gi后的编号：

#!/usr/bin/perl

$filename

="sequence.fsa";

open(FILE,

$filename)

||

die("Couldn't

read

file

$filenamen");

while

（$line

=）{

if($line

=~

/^>gi|([0-9]+)/

){

print

($1

."n");

}}

close

FILE;

输出到新文件可以使用命令行重定向符>，例如：perl

程序名.pl

>list.txt

或在程序中打开然后写文件，类似

收获者888

的代码：

#!/usr/bin/perl

$filename

="sequence.fsa";

$outname

="list.txt";

open(FILE,

$filename)

||

die("Couldn't

read

file

$filenamen");

open(OUTFILE,

$outname)

||

die("Couldn't

open

file

$outnamen");

while

（$line

=）{

if($line

=~

/^>gi|([0-9]+)/

){

print

OUTFILE

($1

."n");

}}

close

FILE;

close

OUTFILE;

以上代码中文件名都是相对路径，即运行时当前目录，需要将那个sequence.fsa拷到当前目录再执行。

另外，如果不能运行，请将出错提示贴上来，便于分析。

Perl入门教程

打开文件的常用方法是: open(FH, "< $filename") or die "Couldn't open $filename for reading: $!"; open() 函数通常带有两个参数，个为文件句柄，用于指向打开的文件， 第二个参数是文件名及模式(文件的打开模式)的混合体，如果文件被成功打开， open()函数返回true，否则为false。我们用“or”来测试该条件。 上述代码中的模式由小于字符(<)来表示。如果文件不存在，open()将返回false。 此时，你可以读文件句柄，但不可以写。 大于字符表示写。如果文件不存在，就会被创建。如果文件存在，文件被清除， 以前的数据将会丢失。你可以写入文件句柄，但不可以读入。 # 如果文件不存在，就创建它 open(FH, "> $filename") or die "Couldn't open $filename for writing: $!"; 如果文件不存在，添加模式(用两个大于符号表示)可以用来创建新文件，如果文 件存在，该模式并不会清除原来的数据。 同“<”或“读”模式一样，你只能对文件句柄进行写作。 (所以的写入内 容都添加到文件尾)。企图进行读作，会产生运行错误。 open(FH, ">> $filename") or die "Couldn't open $filename for appending: $!"; 通过“+<”模式，你可以既可以读文件，又可以写文件。你可以通过l() 函数在文件内部移动，通过seek()函数进行定位。如果文件不存在，就会被创建。 如果文件已经存在，原来的数据不会被清除。 如果你打算清除原来的文件内容，或者自己调用truncate() 函数，或者使 用“+>”模式。 open(FH, "+> $filename") or die "Couldn't open $filename for reading and writing: $!"; 注意“+<”和“+>”的区别，两者都可以可读可写。前者为非破坏性写， 后者为破坏性写。 错误 错误是如何出现的？很多地方都会出现错误：如目录不存在，文件不可写入， 你的程序丢失了文件句柄等等。 你应该检查系统调用的结果 (如open() 和sysopen())，看看是否调用成功。 为了帮助用户查错，通常使用“or die()”，你应记住这些用法。首先， 应写出系统调用失败(“open”)的信息。其次，应写出文件名的信息，以便修正错 误时更容易地定位。第三，要写出打开文件的方式， (“for writing,”“for appending”)。 第四，输出作系统的出错信息(包含在$!中)。这样，一旦出现文件不能打开的问题， 使用你的程序的用户会大体上知道为什么不能打开。有时，我们把个和第三个合并 在一起： or die "unable to append to $filename: $!"; 如果在open() 和出错信息中都写了文件的全名，你会冒改变了open() 的风险， 使得出错信息不合时宜或不正确。 # 下面会出现虚的出错信息 open(FH, " or die "Can't open /var/log/file.pod for writing : $!";

你先学这个

你还没弄明白perl里面变量的特殊处， perl里面的变量分为标量和数组变量。 $fan = @output ; # $fan 建议你看看perl入门教程，会说的更明白些~~

perl程序的运行问题，急急急！！

windows系统 装的是activeperl吗？ 看看环境里面有了没，不行删了重装一下，

cmd 下运行 perl yourfilename.pl 应该没问题的

应该是环境变量设施问题，建议你找个安装教程，重新安装一次