探索 KEGG 网站:生物信息学的宝库
KEGG(京都基因与基因组百科全书)网站是一个综合性的生物信息学数据库,提供有关基因组、基因功能和生化途径的广泛信息。它是生命科学研究人员和从业人员的宝贵资源,为深入了解生物学过程提供了全面的见解。
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KEGG 特点:
基因组注释:提供超过 20,000 个物种的基因组注释,包括基因列表、染色体图和注释功能。 通路图:囊括 500 多条经过注释的生物化学和细胞过程途径,以交互式图形方式呈现。 化合物和物数据库:包含超过 70,000 种化合物和 12,000 种物,提供了它们的结构、属性和生物活性信息。 疾病数据库:提供有关 5,000 多种疾病的简洁信息,包括致病、治疗和预防措施。 BRITE 功能层次结构:将基因组数据组织成一个分层的系统,使研究人员能够探索不同生物学功能之间的联系。
如何使用 KEGG 网站:
KEGG 网站的用户界面简单易懂。用户可以使用或 ID 号搜索特定基因、通路或化合物。搜索结果以交互式图形和表格的形式呈现,允许用户浏览和提取相关信息。此外,还可以下载交互式图表和数据用于进一步分析。
KEGG 的应用:
KEGG 网站在生命科学研究中有着广泛的应用,包括:
基因功能鉴定:确定基因的潜在功能和参与的生物过程。 通路分析:研究细胞过程的动态变化和扰动的影响。 物发现:开发靶向特定生物途径的新和疗法。 生物标志物鉴定:识别与疾病相关的基因和通路,用于诊断和治疗。 系统生物学:整合多组学数据以获得对复杂生物系统更全面的了解。
结论:
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